据《天变邸抄》中的描述：明天启六年五月初六(公元1626年5月30日)早晨，京师〔北京)夭色皎洁，突然一声巨响，如同天崩地裂，顿时间烟尘弥漫，天昏地暗。狂飙骤起，人畜、树木、砖石等被卷入空中，又随风落下，数万房屋尽为齑粉，死伤二万余人，让人心惊胆战，触目惊心。与狂飙骤起同时，地下大震，屋宇动荡，房倒屋塌，房梁、椽条、窗户、瓦片像落叶一样纷纷飘落，火光冲天，毁坏房屋数千间，同时还出现地陷，有人还被陷入地中。

出事之时，明熹宗朱由校正在乾清宫用早膳，突然，他发现大殿震荡起来，不知发生了什么祸事，吓得不顾一切就逃。跃出门外，他急忙拼命向交泰殿狼狈奔去，内侍们惊得不知所措，只有一个贴身内侍紧跟着他跑。不料，刚到建极殿旁，天上忽然飞下一块鸳鸯瓦，正巧砸在这个内侍的脑袋上，当即脑浆迸裂，倒地而亡。熹宗皇帝也顾不上他了，一口气跑到交泰殿，正好殿内墙角有一张大桌子，他连忙钻進去，才躲过此劫。

爆炸发生后，消息迅速传遍了全国，无论是王公贵族还是黎民百姓都感到十分惶恐，认为此次灾变与当前国家的政治腐败、宦官专权局面有很大的关系，是上天对皇帝的警告。在舆论的压力下，皇帝下了一道“罪己诏”，表示要“痛加省修”，决不让此类现象再次出现，并从国库拨出黄金一万两以救济灾民。

爆炸使老百姓死伤惨重，这次爆炸事件中出现的许多诡异现象更让广大民众惶恐不安。例如在此次灾难中，出现了人群失踪现象。据记载，宣府杨总兵一行连人带马共七人没了踪影；承恩寺街上行走的女轿，事后只见轿具被打坏在街心，轿中女客以及八个轿夫都不知去向；西会馆的塾师和学生共三十六人，在爆炸之后，也全都没有了踪影。

除了失踪让人觉得诡异之外，奇怪的“脱衣现象”更让人百思不解。据当时的史料记载，这次事件中，不论男女，不论死活，也不管是在家还是在路上，很多人衣服鞋帽尽被刮去，全为裸体。如《天变邸抄》中记载道“所伤男妇俱赤体，寸丝不挂，不知何故。”《日下旧闻》中记有这样一件事:元宏街有一乘女轿经过，只听一声震响，轿顶被掀去，女客全身衣服都被刮走，赤身裸体坐在轿中，竟没有伤及皮肉。他们的衣服哪里去了呢?据《国榷》记载，震后，有人发现那些衣服全挂在西山的树梢上，昌平县校场也是衣服成堆，此外还有器皿、首饰和银钱等.

另据一些史书记载，其实在爆炸发生之前，便出现了一些离奇的征兆。如《东林始末》记载，五月初二夜间，前门楼角出现有几百团飘忽不定的火焰，不一会儿，这些火焰合并成一车轮大的一团。另据《天变杂记》记载，后宰门有一火神庙在六日早晨传出奇怪的音乐声，一会儿声粗，一会儿声细。看门的刚要進去查看，忽然有个大火球一样的东西腾空而起，不一会，东城便发出震天爆炸声。这火焰和火球与大爆炸究竟有何关系?

对于王恭厂特大爆炸事件，三百多年来历史学家和科学家一直在研究和探讨，但一直没有定论。比较多的人认为，是当时位于爆炸中心的一座手工军火工场—王恭厂内火药爆炸所致，所以此次灾难又称“王恭厂奇灾”。但据爆炸专家估算，根据史料中记载的情况，奇灾相当于三万吨黑色火药爆炸的能量，然而王恭厂内贮存的火药最多不超过几百吨，根本形成不了如此大的冲击力。

有人根据当时出现了“飓风一道，内有火光”，“西安门一带皆霏落铁渣，如麸如米者，移时方止”，以及呈方向性的冲击波、陨击坑等记载，认为此次灾难可能系陨星坠落造成的。但是爆炸后，在现场并没有发现任何陨石。地震学专家则认为，此次灾难是地震所致。还有人则提出是隐火山热核强爆、龙卷风，更有甚者认为是外星人入侵、UFO降临等。但任何一种观点，都没有足够的说服力。

有专家则对十几种被认为有可能的爆炸原因進行分析，并结合灾变过程、破坏范围等史料记载，认为此次事件是自然灾害为主导，火药爆炸推波助澜。但究竟是什么天灾?是一种天灾还是几种天灾共同作用的结果?仍没有足够的论据来加以论证。

尤其是爆炸后出现的“人群失踪现象”和“脱衣现象”，更是令现代科学的理论无法解释的。因为炸死了人也会有尸体或被炸断的肢体残骸存在，怎么能几十人都没有了踪影呢。“脱衣现象”更是令人匪夷所思，因为一个人要脱去全身内外衣裤，必须要举手抬脚才能做到。怎么会一声震响后，全身衣服都被刮走，变成赤身裸体了呢。强风刮去衣服，也先要把衣服吹破裂，才能刮去，那总有衣服撕碎的破片存在，不可能象变戏法似的，一下子就将人穿着的衣服不经手脚就脱了出来，而且还挂在另处的西山树梢上，和堆在昌平县校场上。就象是有一种神秘的力量在做这件事情，那么这种神秘力量又是来自什么地方呢？ 现代科学恐怕永远地也无法解释这个谜。