人类为了抢夺潘多拉星球的稀有矿物质而进行“阿凡达计划”，通过潘多拉星球纳美人基因和人类基因制造出阿凡达，希望阿凡达潜伏到纳美人中当卧底，从而达到掠夺资源的目的。

退役海军士兵杰克同意化身阿凡达做卧底是出于无奈，军方承诺在事成之后出钱帮助医治他瘫痪的双腿。

潘多拉星球充满着浪漫、和谐、神秘与壮观的气息，参天巨树、神秘植物、飘浮在空中的群山、色彩斑斓的茂密雨林、如同水母般的树种、各种会发光的动植物……这与因人类贪婪自私而被严重污染破坏的地球形成鲜明对比。杰克化身并受杰克思维操控的阿凡达来到潘多拉星球后，遭遇到奇异猛兽的袭击，纳美族公主出手相救，并把他带回了纳美族。阿凡达开始向纳美人学习语言、骑马、操控飞龙等技术。他经过艰苦惊险的努力不仅获得了公主的爱情，也被纳美人所接受，杰克获得了信任，卧底成功。

作为特务和卧底是痛苦的，特务的内心有一块黑暗的角落，这里藏匿着谎言和毒箭，谎言和毒箭欺骗着别人和自己，伤害着别人和自己。

潘多拉星球和纳美人向杰克打开了一个全新的世界，身体和心灵不受束缚的在大地、森林和天空中翱翔，回归本原和自然的自由快乐使杰克暂时忘记了卧底的龌龊肮脏。

人类的入侵开始了，杰克面对着巨大的痛苦折磨，一方面梦幻般美好的星球化为战火屠城，一方面对他信任有加的公主和纳美人将发现他的特务卧底身份，他同时发现，人类是不在乎他这个卧底的性命安全的，在他完成了卧底任务后，人类的战车竟向他开枪。

杰克内心的良知觉醒了，其标志是他毅然的向纳美人公开说出了自己的特务卧底身份，告别了谎言，同时也使内心的黑暗一扫而空。

杰克的自我救赎开始了。影片开始了让人荡气回肠的内容，杰克降服了巨大的飞龙之王成为统帅纳美人的领袖，面对众人振臂高呼的情节，使人激情荡漾，顿生豪情。

影片最精彩的是片尾20分钟纳美人在阿凡达的带领下和人类作战的场面，完全值得被写进电影史。纳美战士骑着战马和飞龙，与人类现代高科技飞行器、机器人作战的场面占据了整个星球的天空和地面森林。最终纳美人获胜。

杰克最后放弃了人类的身体，精神和身体和二为一而成为了纳美人，他获得了新的生命。杰克其实并没有真的背叛人类，他决裂的是道德堕落的人，抛弃的是人类自私、贪婪和邪恶的一面，从而获得了一个善良、正义和回归自然的新生命，这个新生命恰恰是人类人性的觉醒，充满着善良、关怀和正义的人之本性。

同时，电影《阿凡达》也给在全世界所有做着特务卧底工作，而同时在干着灭绝人性坏事的特务卧底们一个启示：回头是岸，觉醒、救赎和新生！@