不仅后人的实验无法验证“进化假说”的成立，一些被科学界公认的许多科学事实也能对“进化假说”形成直接挑战。

俗话说，“种瓜得瓜，种豆得豆”，它表明了生物界中物种一旦产生就各从其类稳定繁衍后代、保护其物种稳定存在下去的自然规律，这也是生物学中不变的铁律。

5.3.1 环境不能改变物种

现代分子生物学研究表明，所谓环境压力或因素大多影响的是表观遗传学的变化，是基因表达的变化，并不是基因编码本身的变化。

大肠杆菌经过数万代繁衍也未变成新细菌的实验，说明了环境的变化通常只会令物种自身发生微小的变化，一个物种是不可能通过环境的选择压力选择出所谓的“优势”基因突变，从而产生新物种的。

生物物种对环境的适应，往往是通过对基因表达的调控来适应的，所以环境压力改变物种的说法欠缺科学依据，环境变化不能改变物种。

5.3.2 亘古不变的“活化石”

有一些被人们称之为“活化石”的物种，它们很古老且一直没有发生“进化”，比如植物中的银杏、蕨类和动物中的熊猫，它们都经过了漫长的地质年代，依然没有“进化”。

腔棘鱼（coelacanth）也叫“四腿鱼”，可谓是地球上的活化石，这是一种来自4.2亿年前的远古鱼类。最近科学家在东非的热带岛国马达加斯加意外地发现了它的踪迹。⁵⁵

这表明生物物种的基因通常是非常稳定的。大自然有足够的时间，这些物种的生存环境也在改变，可是它们却一直没有变种。

一百多年来，科学家们试图找到从一个物种转变成另一个物种的证据，但各种尝试几乎都失败了。

新冠病毒感染了全世界超过6亿人，经历了大量的突变，全世界掀起大规模的抗病毒药物治疗和疫苗接种，但新冠病毒至今仍是新冠病毒，未发生变种；大肠杆菌繁殖了几万代，还是大肠杆菌；流感病毒变异了这么多年，还是流感病毒。人们从来也没有观察到任何一个生物变化成另外一种生物的奇特现象。

5.3.3 “人工育种”不产生新物种

当达尔文写《物种起源》一书时，他不能提供任何自然选择进化的实例，所以他借用了一些人工选种的例子。例如，他用鸽子做实验，人工选择了不同的特征，如喙的大小、形状和颜色，并证明可以改变这些鸽子的特征，似乎想要通过这些实验证明自然选择可以达到从一个物种变化成另一个物种的效果。

但是，这些鸽子仍然都被归类为鸽子。达尔文1868年1月发表《动物和植物在家养下的变异》⁵⁶（The Variation of Animals and Plants under Domestication），书名写的只是变异（Variation），不是“变种”。

人工育种，只是让动物或植物的基因组的不同组合显示出来，不能算作创造新物种。

要成为一个新物种，需要形成一个新的生物群体，这个群体能够独立繁殖后代，而且与原有的群体无法进行交配并繁殖出有生育能力的后代。

例如，马和驴交配可以生出骡子。因为马和驴的染色体数量分别为64条和62条，所以骡子的染色体是63条⁵⁷，拥有奇数条染色体的骡子无法繁殖后代。因此，从生物学角度看，骡子并不是一个真正的“种”。

我们日常所食用的无籽西瓜是普通二倍体西瓜与经秋水仙素处理后的四倍体西瓜的杂交一代⁵⁸，因为含有奇数倍（三倍）的染色体，配子无法进行配对，所以三倍体西瓜（无籽西瓜）无法产生正常成熟的西瓜种子。这样的西瓜虽然果肉可以吃，但是因为没有后代，也不能算作一个真正的独立的种。

不能繁殖后代的现象，生物学称为“生殖隔离（Reproductive Isolation）”现象，通常指由于生殖或生物学原因，即使地缘关系相近，物种不同的类群之间也不能成功地交配出具有繁殖能力的后代。这恰恰说明自然界中每个物种都有保持其物种独特性稳定下去的自然机制。⁵⁹

正因为如此，达尔文的实验品──所有经过杂交的家畜回到大自然后，复杂的变种很快就消失了，生还者都恢复到原本的野种⁶⁰。即使是最高明的育种家也不能创造出任何新物种。

法国科学院院长、动物学家皮埃尔-保罗‧格拉斯（Pierre-Paul Grasse, 1895—1985）认为，“人工育种的例子是反对达尔文学说的有力证据。虽然经过千年选种的压力，任何不符合育种目标的个体都被消灭了，但是始终都没有新种出现。化验比较各种狗的血清、血红素、血蛋白和受精的可能性都显示，所有不同品种的狗，其实仍然属于同一个生物种。这项结论是客观测试的结果，不是主观分类学上的意见。”

所以，自然界之中不存在两种物种之间正在演变的中间物种及人工育种无法创造新物种的事实，恰恰说明物种具有保持其稳定性、不可能随便进化的自然规律。物种不但不能进化，反而需要保持原始本质才能生存下去。达尔文的进化论在本质上违反了这一千古不变的自然规律。